りんごのナレーション
その じけんは
わたし あんどうりんごが
いつものように
「ぶつりぶ」のぶしつで
クラスメイトや せんぱいと
ぶかつどうをしていたとき
とつぜん おこった…
りんご
#物理部の部室
#テーブルの上にはグラグラ煮えている三角フラスコ二つ
#考え込んでいる
うぅ〜ん
なかなかうまくいかないなあ
ぶつりてき かがくてきに
かんがえると…
まぐろ
やあ りんごちゃん★
なにをしてるんだい？
りんご
あ まぐろくん
この ぷよぷよした
ナゾのぶったいは
４つつなげると きえるはず
そのしくみを
しょうめいするための
じっけんだよ
まぐろ
へえ〜★
#肩すくめて
あいかわらず
きそうてんがいだね★
りんご
#げんなり顔で汗タラ
うう〜
ほんとうなのに…
りすくませんぱい
やあ ようこそ
ぶつりぶの ぶしつへ
りんご
あ りすくませんぱい
りすくませんぱい
ひび これ じっけん…
まぐろくんも ひとじっけん
していくかい？
まぐろ
ボクは けっこうです★
りすくませんぱい
そうか ザンネンだ
りんご
…ところで
りすくませんぱい
なんだい？
りんご
その ぐらぐらにえている
フラスコはなんですか？
りすくませんぱい
ああ これは
ひじょうにキケンなじっけんの
さいちゅうでね
シッパイすると
ダイバクハツするから
きをつけてくれたまえ
りんご
えっ…
#大爆発。画面真っ白に
#月夜のプリンプタウンに、流星が三つ落下。遅れてもう一つ落ちる
→
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※各24キャラごとに全８話のストーリールートがあり、微パラレル的に展開。
※全キャラをクリアすると「エクストラ」が出現。エクストラクリアでエピローグとなる。
※物語全体の根幹となる本伝的ルートと、ほぼ関わらない外伝的ルートがある。大半は外伝。
※《本伝》だけを拾う意図で読む順番を付けるなら、以下のようになる。
《本伝》（物語内の時間軸は、各編の選択可になる順番とは異なる）
プロローグ→りんご編→《レムレス編＊》→アコール先生編→（アルル編/シェゾ編/エコロ編）→《アミティ編＊》→カーバンクル編→サタン編→エクストラ→エピローグ
＊アミティ編、レムレス編は本伝ストーリーそのものには関わらない。しかしアミティは赤ぷよ帽を介して何かの予兆を感じ、レムレスは虫寄せの木に「黒くて素早く動くもの」（エコロ？）を見たと話していて、関連がほのめかされている。